Протокол о внесении изменений в Соглашение был подписан 17 апреля 2019 года в Москве. Документом, в частности, предусмотрена возможность уточнения утверждённых индикативных балансов при условии учёта обоснованного изменения внутреннего потребления нефтепродуктов на территории Таджикистана.
Также закрепляется обязанность Таджикистана представлять предложения по формированию индикативных балансов на следующий календарный год и информацию о выполнении индикативных балансов за 9 месяцев и об их ожидаемом выполнении за текущий календарный год.
Кроме того, вывозимые из России в Таджикистан нефтепродукты будут декларироваться без применения временного периодического таможенного декларирования, установленного законодательством РФ. Исключение составит вывоз нефтепродуктов, поставляемых смешанными видами транспорта с использованием трубопроводного транспорта в соответствии с индикативными балансами.