Елена Ивановна Шерышева родилась 15 июня 1964 года. В 1989 году окончила МГИК, а в 2012 году – Национальный исследовательский университет «Высшая школа экономики».
Около 20 лет работала на различных должностях в сфере образования, в том числе в Управлении международного образования и сотрудничества Федерального агентства по образованию, Департаменте международного сотрудничества Министерства образования и науки Российской Федерации.
С сентября 2012 по ноябрь 2013 года – в Департаменте социальной политики и информационного обеспечения Постоянного комитета Союзного государства.
С 2013 года – в Департаменте международного сотрудничества Министерства транспорта Российской Федерации.
С 4 декабря 2020 года назначена на должность заместителя директора Департамента транспорта и инфраструктуры Евразийской экономической комиссии.
В 2019 году награждена медалью ордена «За заслуги перед Отечеством» II степени и медалью «За вклад в развитие Евразийского экономического союза».