ФТС провел анализ состояния работы таможенных органов по контролю за соблюдением законности за девять месяцев 2004 года. Сообщается, что остается высоким количество постановлений по делам об административных правонарушениях, измененных или отмененных в связи с нарушениями требований действующего законодательства. В текущем году ФТС России было оставлено без изменения только 5% постановлений таможенных органов по делам об административных правонарушениях, иными таможенными органами - 33% постановлений подчиненных таможенных органов. Остается высоким количество решений об отмене постановлений и прекращении производства по делам. ФТС признает, что таможенными органами необоснованно возбуждаются дела об административных правонарушениях, в ходе административного расследования допускаются неполнота производства, неправильная квалификация правонарушений, нарушения прав лиц, привлекаемых к ответственности.
В текущем году по сравнению с 2003 годом значительно увеличилось количество постановлений, бывших предметом рассмотрения арбитражных судов. Также рассмотрение жалоб на местах проходит не в полной мере объективно, а принимаемые решения по жалобам не всегда законны.
Наибольшее количество споров между таможенными органами и участниками внешнеэкономической деятельности возникает по вопросам исчисления и взимания таможенных платежей. В основном обжалуются решения, действия (бездействие) таможенных органов, принятые или совершенные при определении таможенной стоимости товаров и кода товаров по ТН ВЭД.
Отмечается, что если РТУ удовлетворяется 33% жалоб на решения, действия (бездействие) по вопросам определения таможенной стоимости товаров и 27% жалоб на решения, действия (бездействие) при определении кода товаров по ТН ВЭД, то ФТС России незаконными признаются соответственно 82% и 33% решений, действий (бездействия) таможенных органов и их должностных лиц.