С 01.01.2004 регионом деятельности Одинцовской таможни определен Волоколамский, Истринский, Красногорский, Лотошинский, Можайский, Наро-Фоминский, Одинцовский(за исключением аэродрома Кубинка), Рузский, Шаховской; города областного подчинения Московской области: Волоколамск, Звенигород, Истра, Красногорск, Можайск, Наро-Фоминск, Одинцово, Троицк, город Краснознаменск областного подчинения, поселок Молодежный областного подчинения. С 1 января 2004 г.Одинцовской таможне передано часть полномочий Зеленоградской, Подольской и Центральной акцизной таможен.