Указом Президента РФ от 11.05.06 № 473 "Вопросы Федеральной таможенной службы" установлено, что руководство Федеральной таможенной службой осуществляет Правительство Российской Федерации. Функции МЭРТ РФ по выработке государственной политики и нормативно-правовому регулированию в области таможенного дела переданы Федеральной таможенной службе. Указ вступает в силу со дня официального опубликования(опубликовано 12 мая 2006 г.).