Рустам Ахмеров родился 12 марта 1982 года в Ульяновской области. Образование высшее: закончил Ульяновскую государственную сельскохозяйственную академию. В таможенных органах с 19 июля 2005 года: свою трудовую деятельность начинал с должности инспектора таможенного поста Аэропорт Казань Татарстанской таможни. С 15 апреля 2011 – начальник отдела инспектирования и профилактики правонарушений Татарстанской таможни.
Имеет звание подполковника таможенной службы.
За безупречную службу удостоен ведомственными наградами: медалями «За службу в таможенных органах» III, II степени, «25 лет Федеральной таможенной службе», нагрудным знаком «Отличник таможенной службы».