Южная оперативная таможня была создана 8 июля 1996 года. Это правоохранительная структура таможенных органов с функциями дознания и оперативно-розыскной деятельности, целью которой является защита экономических интересов государства в сфере внешнеэкономической деятельности. ЮОТ руководит, организует работу и оказывает методологическое содействие правоохранительным блокам десяти таможен региона.
За время работы ЮОТ правоохранительными подразделениями таможен ЮТУ было выявлено более 300 тысяч административных правонарушений, возбуждено более 7 тысяч уголовных дел, пресечено свыше 2800 фактов контрабанды оружия, боеприпасов, взрывчатых веществ; более 3000 фактов незаконного оборота наркотиков, изъято более 5 тонн наркотических средств и сильнодействующих веществ, около 195 тонн прекурсоров, задержано незаконно перемещаемой иностранной и российской валюты, валютных ценностей на сумму более 390 млн рублей, 30 млн долларов США, около 7,8 млн евро, около 290 кг ювелирных изделий из золота, более 500 кг изделий из серебра.
Исполняющий обязанности начальника Южной оперативной таможни Виталий Кухаренко, поздравляя личный состав с днем образования таможни, пожелал коллегам дальнейших успехов и достижений в защите национальных интересов и обеспечении экономической безопасности России.