В правительстве отмечают, что административная реформа, проведённая в 2004 году, привела к раздробленности системы государственного ветеринарного надзора. По результатам мониторинга, проведенного Россельхознадзором, в деятельности государственной ветеринарной службы субъектов Федерации выявлены проблемы. Совмещение функций по оказанию платных ветеринарных услуг и осуществлению регионального государственного ветеринарного надзора негативно сказывается на объективности контрольно-надзорной деятельности. При проведении контрольных мероприятий региональные власти скрывают, например, очаги заразных болезней животных и случаи несвоевременного исключения из оборота заражённой животноводческой продукции. Отсутствие должного контроля за организацией и проведением противоэпизоотических мероприятий привело к снижению уровня безопасности продукции.
В связи с этим правительство предлагает снять с регионов полномочия по ветеринарному надзору и передать их в полном объёме на федеральный уровень. При этом устанавливается полный запрет на обратную передачу полномочий.