В условиях введения различных ограничений и запретов работа Санкт-Петербургской таможни и подчиненных таможенных постов осуществляется в штатном режиме.
В отношении определенных категорий товаров, относящихся к товарам первой необходимости, таких как продукты питания, лекарственные средства, средства гигиены и другие, установлен первоочередной порядок совершения таможенных операций.
В марте 2022 года на таможенные посты Санкт-Петербургской таможни прибыло около 4 тысяч тонн продуктов питания и товаров первой необходимости по 1100 товарным партиям. Среднее время завершения таможенной процедуры таможенного транзита составило 1 час.