Рустам Турдубекович Джапаров родился 16 марта 1982 года в Кыргызской Республике.
Окончил Рязанский институт воздушно-десантных войск, Кыргызскую государственную юридическую академию.
Работал на различных должностях в Министерстве обороны Кыргызской Республики и Государственном комитете национальной безопасности Кыргызской Республики. Являлся заместителем директора «Координационного центра по обеспечению кибербезопасности» с момента его создания. Реализовал ряд проектов направленных на обеспечение информационной и кибербезопасности информационных систем Кыргызской Республики. Под руководством Джапарова были запущены 1 и 2 этап национальной системы мониторинга киберугроз Кыргызской Республики, что позволило значительно продвинуться в расследовании компьютерных атак и инцидентов, а также наладить взаимодействие с международными организациями, которые специализируются на кибербезопасности.
С 14 октября 2021 года назначен на должность заместителя директора департамента информационных технологий Евразийской экономической комиссии.